O Colégio Presbiteriano Agnes Erskine foi fundado em 16 de agosto de 1904. Sua história está ligada ao trabalho missionário presbiteriano no Norte do Brasil. Sua fundadora foi Miss Elisa Reed, missionária americana enviada pelo Board de Missões da Igreja Presbiteriana do Sul dos Estados Unidos, o colégio é  subordinado à Igreja Presbiteriana do Brasil.