Química é definida como a ciência das transformações e abrange três mundos distintos, sendo o mundo macroscópico, microscópico e o mundo Nano. O curso de Química da Universidade Presbiteriana Mackenzie, foi fundado em 1974, e é pautado no sólido conhecimento nas áreas de Química- Físico-química, Química inorgânica, Química Orgânica, Química analítica e nanotecnologia, além de excelente infra-estrutura (salas de aula, laboratórios de ensino e pesquisa). O curso de Química está localizado na Escola de Engenharia da Universidade Presbiteriana Mackenzie no qual está diretamente interligado com os cursos de engenharias de Materiais, Civil, Produção, Mecânica e Elétrica promovendo a criatividade dos graduandos e amplas colaborações no desenvolvimento de novos nanomateriais, energia, processos industrias e meio ambiente, etc. Sendo assim, os alunos formados no curso de Química poderão atuar em distintas áreas da ciência, como por exemplo, Medicina, Biologia, Farmácia, síntese de novos materiais, desenvolvimento de processos químicos industriais, estudos do meio ambiente, além das áreas de perícia e em centros de excelência em pesquisa. Além disso, os professores que fazem parte do curso de química oferecem oportunidades interessantes para estudo e pesquisas nas fronteiras da ciência química. A Universidade Presbiteriana Mackenzie oferece os cursos de graduação em Química bacharelado e  licenciatura em Química, que podem ser contemplados em um único curso. Além disso, o aluno poderá adquirir também a atribucão tecnológica em química cursando algumas disciplinas eletivas do curso de engenharia de materias da Escola de Engenharia.