As pesquisas do Programa têm recebido financiamento de agências de fomento como a Financiadora de Estudos e Projetos (FINEP), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP), do Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (CNPq), do Ministério da Educação (CAPES), do Fundo Mackenzie à Pesquisa (MackPesquisa) e de parcerias com empresas do setor produtivo.
De 2021 a 2024 a quantidade de projetos em que o programa esteve envolvido com cada financiador foi o seguinte:
- FINEP: 3 projetos no valor de R$ 9,3 milhões.
- FAPESP: 6 projetos no valor de R$ 3,4 milhões.
- CNPq: 23 projetos no valor de R$ 1,9 milhões (envolvendo projetos de bolsas produtividade e tecnológica).
- CAPES: 5 projetos no valor de R$ 2,2 milhões (incluindo projetos associados no PrInt).
- MackPesquisa: 7 projetos no valor de R$ 899 mil.
- Setor Produtivo: 6 projetos no valor de R$ 3,8 milhões.
Durante este quadriênio o programa recebeu mais de R$ 21 milhões de reais em financiamento à pesquisa, sem incluir os investimentos das bolsas concedidas pela CAPES (PROSUC-I e PROSUC-2) e MackPesquisa (isenções de mensalidades).