As pesquisas do Programa têm recebido financiamento de agências de fomento como a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP), do Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (CNPq), do Ministério da Educação (CAPES), do Fundo Mackenzie à Pesquisa (MackPesquisa), de agências reguladoras (ANEEL) e de parcerias com empresas do setor produtivo.
De 2017 a 2020 a quantidade de projetos em que o programa esteve envolvido com cada financiador foi o seguinte:
- FAPESP: 6
- CNPq: 8 (envolvendo projetos de bolsas produtividade e tecnológica)
- CAPES: 3 (incluindo projetos associados no PrInt)
- ANEEL: 1
- MackPesquisa: 7
- Setor Produtivo: 23
Durante este quadriênio o programa recebeu mais de R$ 10 milhões de reais em financiamento à pesquisa, sem incluir os investimentos das bolsas concedidas pela CAPES (PROSUC-I e PROSUC-2), CNPq (DAI e MAI) e MackPesquisa (bolsa mérito e isenções de mensalidades).