O PPG em Engenharia Elétrica e Computação esta administrativamente ligado a duas Unidades Acadêmicas da UPM: Escola de Engenharia (EE) e Faculdade de Computação e Informática (FCI).

A Coordenação do Programa é alternada por um docente de cada uma das áreas de concentração do Programa. A gestão no quadriênio 2021-2024 está sob a responsabilidade da EE que por meio de indicação da direção da unidade, ouvida as instâncias superiores como Pró-Reitoria e Reitoria, nomeou a Profa. Lúcia Akemi Miyazato Saito como coordenadora neste período.

Por questões regimentais a UPM não tem Vice-Coordenador(a) em seus Programas de Pós-Graduação, mas o Prof. Paulo José de Aguiar Simões, representante docente da área de Aplicações Geoespaciais, tem assumido o papel de eventual substituto durante este quadriênio.